Martínez Contreras, Rebeca DéboraMARTINEZ CONTRERAS, REBECA DEBORA; 84940Martínez Montiel, Mónica2019-05-282019-05-282016-11-01https://hdl.handle.net/20.500.12371/2489"Se le denomina splicing a un proceso que se lleva a cabo en eucariotas en el cual el ARN mensajero sufre la eliminación de secuencias internas no codificantes llamadas intrones y la unión de secuencias codificante denominadas exones, las cuales se unen a secuencias consenso denominados elementos en cis que se encuentran en la misma secuencia del pre-ARNm. Además del spliceosoma, en el splicing alternativo participan las proteínas reguladoras que corresponden a las SR y hnRNPs. La proteína hnRNP A1 se une al pre-ARNm y en general favorece la omisión ya sea de los intrones o de los exones. Esta proteína está constituida por dominios estructurales ligados por un conector de longitud variable. El dominio que prevalece en estas proteínas es el denominado RRM, el cual presenta una estructura tridimensional característica (β1 α-1-β2-β3-α2-β4) y además incluye dos secuencias RNP altamente degeneradas, RNP-1 y RNP-2. Los mecanismos por los que hnRNP A1 reprimen un sitio de empalme se han examinado en pocos casos. Por otro lado, se ha visto que en algunos tipos de cáncer la proteína hnRNP A1 se ve sobrexpresada, haciendo importante su estudio. En este trabajo se analizó la proteína putativa de hnRNP A1 de Ustilago maydis. Inicialmente, se realizó el análisis in silico de la proteína para identificar al homólogo en Ustilago maydis y se comparó la estructura tridimensional de ambos péptidos, así como su interacción con otras proteínas. Pudimos observar que ambas proteínas espacialmente son similares y que los aminoácidos responsables de la interacción con el pre-ARNm se encuentran conservados. Se buscaron las secuencias de pegado reportadas para hnRNP A1 en el genoma de U. maydis empleando el programa GeneFinder, encontrando que la secuencia más prevalente fue el repetido AGGGA, encontrado en el 42.5% del genoma del hongo, sugiriendo que pudiera tener una función relevante en la regulación de la expresión en este organismo. De manera interesante, algunos de los genes que presentan esta secuencia reguladora se encuentran también en los homólogos para humano y dichos homólogos están implicados en cáncer o en enfermedades humanas. Por otro lado, se construyeron versiones truncas de la proteína umhnRNP A1, las cuales incluían diferentes dominios de unión al ARN. Una vez obtenidas las proteínas recombinantes, se llevó a cabo su expresión y su identificación mediante Western Blot. En general, las evidencias obtenidas sugieren que hnRNP A1 se encuentra altamente conservada entre U. maydis y humano y se propone que pueda tener una función similar en ambos organismos".pdfspaBiología y QuímicaSplicingEmpalme de ARNCélulas eucarióticasTesis de maestríaUstilago maydisHuitlacocheopenAccess