Identificación y caracterización de los factores involucrados en decaimiento de ARN mensajero sin sentido (NMD) en Ustilago maydis
Date
2016-01
Authors
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Publisher
Benemérita Universidad Autónoma de Puebla
Abstract
“Los sistemas de control de calidad responsables de la adecuada traducción de proteínas son esenciales para fisiología y sobrevivencia de la célula. En células eucariotes, algunas moléculas de ARNm dejan el núcleo después de sufrir un evento de splicing y pueden desencadenar un proceso de decaimiento el cual puede ser dependiente de EJC (Exon Junction Complex) o de DSE (Down Stream Element) en mamíferos y levaduras, respectivamente y cuya finalidad es arrestar la traducción de dicho mensajero. En este trabajo se realizó un análisis bioinformático de la maquinaria de NMD para un total de 299 eucariotes cuyo genoma se ha secuenciado completamente y la información correspondiente se encuentra liberada, incluyendo 99 metazoarios, 48 plantas, 109 hongos y 43 protistas. Se analizaron 70 factores para NMD empleando la base de datos KEGG y se determinó la distribución para estas proteínas. Los factores identificados participan en NMD pero pueden estar involucrados también en el splicing y procesamiento del ARNm, así como en la vigilancia, exporte y degradación del ARN. Se encontró que en los organismos estudiados la vía general de NMD es similar, pero se pueden observar ligeras diferencias dependiendo del grupo en cuestión”.
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