Análisis in silico de los genes implicados en la virulencia de bacterias patógenas oportunistas aisladas de agua para consumo humano
Date
2021-04
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"El objetivo de este trabajo fue identificar in silico algunos genes y marcos de lectura abierta implicados en la virulencia de las especies P. fluorescens, P. alcaligenes, P. poae, P. salomonii, A. hydrophila, A. caviae y A. veronii; marcos de lectura abierta y genes que codifican proteínas homólogas a las que controlan el quorum sensing, la formación de biopelícula y la resistencia a antibióticos, así como analizar in silico la presencia del operón psl empleando los genes de P. aeruginosa como control, mediante el uso de herramientas bioinformáticas como las bases de datos internacionales de genes y el algoritmo de alineamiento de secuencias BLAST.
De la búsqueda de genes en las bases de datos se obtuvieron resultados de genes implicados en virulencia no documentados en la literatura para P. fluorescens, P. alcaligenes y P. poae. En el análisis de alineamiento de la secuencia aminoacídica de los genes implicados en virulencia (lasR, pelA, pslA, oprD) los porcentajes de identidad en todas las especies fueron variables, siendo P. fluorescens y P. poae las principales especies en presentar homología de secuencias con los cuatro genes estudiados, además el gen pslA fue el principal en presentar homología con todas las especies."
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