Estudio de las regularidades de la estructura espacial de los fragmentos dúplex del ADN con diferentes conformaciones en las cadenas azúcar-fosfato
Date
2023-07
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Publisher
Benemérita Universidad Autónoma de Puebla
Abstract
"Durante más de seis décadas se han estudiado las características estructurales presentes en la doble hélice de Watson y Crick, considerando las contribuciones que aportan las subunidades del ADN a la doble hélice de las configuraciones principales BI, BII, AI y AII. se encontró que las características de estas configuraciones están predeterminadas en la estructura de los fragmentos mínimos del ADN: desoxidinucléosidos monofosfato. Actualmente se sabe que existen distintas estructuras tridimensionales de la molécula del ADN, las cuales participan en procesos biológicos. En este trabajo ha sido de interés comprender los rasgos característicos que presentan las estructuras dúplex Watson-Crick del ADN, cuyas cadenas azúcar-fosfato se encuentran en conformaciones distintas a las configuraciones principales, en particular, se estudiaron las conformaciones BB00, BB01, BB12, BB13, BA09 y BB02. Se evaluó la viabilidad del método teórico computacional para modelar estas características. Mediante el método de la Mecánica Molecular, y los Campos de Fuerzas AMBER: FF99, OL15 y BSC1, se realizaron optimizaciones geométricas a los fragmentos mínimos que constituyen al ADN desoxidinucléosido monofosfato complementario, desoxidinucléosido monofosfato y fragmento mínimo de esqueleto azúcar-fosfato, con el fin de comprender las propiedades que estos aportan a la estructura espacial de esta macromolécula".
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