Estudio in silico de las interacciones GPCR ligando en un ambiente de baja electrostática
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Date
2025-12
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Benemérita Universidad Autónoma de Puebla
Abstract
“Los receptores acoplados a proteínas G (GPCR por sus siglas en inglés) son proteínas localizadas en la membrana celular, siendo su principal función biológica la respuesta de la célula a estímulos externos (señalización celular). Esta función depende en gran medida de sus dominios transmembrana, cuyas estructuras son de tipo helicoidal, por lo que su preservación es clave en los estudios computacionales. Sin embargo, el ambiente que los rodea no es el mismo que el de las proteínas solubles. Rodeadas de moléculas lipídicas y diferentes componentes de la membrana celular, el ambiente electrostático decrece a valores cercanos de constante dieléctrica entre 4 y 20. Esta diferencia con respecto a las proteínas solubles es de gran relevancia, ya que las interacciones proteína–fármaco pueden verse alteradas, lo que podría impedir una descripción adecuada y afectar los resultados de las pruebas in silico. Desafortunadamente, es una práctica común en el estudio de este tipo de sistemas, usar modelos de agua populares como solventes cuyas constantes dieléctricas superan valores de 65, por lo que no logran representar el ambiente de baja polaridad observado experimentalmente. En este trabajo presentamos un nuevo modelo de agua que describe este decaimiento electrostático del solvente. Modificando el ángulo H-O-H para ajustar su momento dipolar, hemos desarrollado un modelo de solvente que representa el entorno de baja electrostática, típico de los sistemas de membrana”.
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