Estudio computacional de las regularidades de la estructura espacial del G-Cuádruplex y de sus complejos con flavonoides

Simple item page
dc.audiencegeneralPublic
dc.contributorDeriabina, Alexandra
dc.contributorPoltev, Valeri
dc.contributor.advisorDERIABINA, ALEXANDRA; 242607
dc.contributor.advisorPOLTEV, VALERI; 19531
dc.contributor.authorSánchez Pérez, Juan Carlos
dc.creatorSANCHEZ PEREZ, JUAN CARLOS; 645512
dc.date.accessioned2025-11-25T17:55:04Z
dc.date.available2025-11-25T17:55:04Z
dc.date.issued2025-08
dc.description.abstract"Los G-Cuádruplex son estructuras secundarias del ADN con importancia creciente en biología molecular y desarrollo de fármacos, debido a su participación en procesos como la regulación génica y el cáncer. No obstante, su complejidad estructural dificulta su caracterización mediante métodos experimentales. Este estudio desarrolla y aplica herramientas computacionales para describir interacciones moleculares, con énfasis en G-Cuádruplex, comparando ángulos de torsión con datos previos de ADN e incorporando descripciones de subunidades como cadenas individuales y pares de guanina no canónicos. Se emplearon campos de fuerza AMBER y CHARMM, junto con métodos electrónicos DFT y técnicas ab initio como MP2, con el fin de caracterizar de manera precisa las interacciones que estabilizan estas estructuras. Los resultados señalan a los enlaces de hidrógeno entre guaninas como principal fuerza estabilizadora del plano tetraplex, mientras que las guaninas cruzadas aportan estabilidad adicional. El análisis con mecánica molecular mostró limitaciones para reproducir el arreglo conformacional completo, sobre todo en interacciones de apilamiento, afectadas por la formación de enlaces de hidrógeno entre guaninas apiladas. Para estudiar este apilamiento se utilizó cafeína como análogo púrico, y métodos de alta precisión (MP2/BSSE y DFT-PBEDH0) lograron reproducir configuraciones experimentales. El trabajo establece un marco computacional aplicable a estudios futuros en biofísica computacional y complejos con flavonoides".
dc.folio20250701162315-4300-T
dc.formatpdf
dc.identificator1
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12371/30604
dc.language.isospa
dc.matricula.creator219570046
dc.publisherBenemérita Universidad Autónoma de Puebla
dc.rights.accesopenAccess
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0
dc.subject.classificationCIENCIAS FÍSICO MATEMÁTICAS Y CIENCIAS DE LA TIERRA
dc.subject.lccFisiología--Bioquímica animal--Sustancias especiales--Sustancias orgánicas--Ácidos nucleicos--Ácidos desoxirribonucleicos--Temas especiales--Estructura
dc.subject.lccFisiología--Bioquímica animal--Sustancias especiales--Sustancias orgánicas--Ácidos nucleicos--Otras sustancias relacionadas--Ácidos nucleicos cuádruplex
dc.subject.lccÁcido desoxirribonucleico--Estructura--Análisis
dc.subject.lccÁcido desoxirribonucleico--Análisis--Procesamiento de datos
dc.thesis.careerDoctorado en Ciencias (Física Aplicada)
dc.thesis.degreedisciplineÁrea de Ingeniería y Ciencias Exactas
dc.thesis.degreegrantorFacultad de Ciencias Físico Matemáticas
dc.thesis.degreetoobtainDoctor (a) en Ciencias (Física Aplicada)
dc.titleEstudio computacional de las regularidades de la estructura espacial del G-Cuádruplex y de sus complejos con flavonoides
dc.typeTesis de doctorado
dc.type.conacytdoctoralThesis
dc.type.degreeDoctorado
Files
Original bundle
Now showing 1 - 2 of 2
Name:
20250701162315-4300-T.pdf
Size:
15.53 MB
Format:
Adobe Portable Document Format
Download
Name:
20250701162315-4300-CARTA.pdf
Size:
1020.25 KB
Format:
Adobe Portable Document Format
Collections
Tesis de Doctorado