Diseño in silico de péptidos antimicrobianos, con base en los parámetros fisicoquímicos y estructurales de los péptidos y de la membrana de la bacteria contra la cual se desea mostrar actividad antimicrobiana
Date
2024-12-18
Authors
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Publisher
Benemérita Universidad Autónoma de Puebla
Abstract
En este curso se enseñará a obtener mutantes apartir de una secuencia peptídica, mediante mutagénesis sitio-dirigida in silico. Se medirán parámetros fisicoquímicos relevantes de las mutantes propuestas: carga neta en cadena lateral, momento y vector del momento hidrofóbico, potencial electrostático, masa molecular, radio hidrofóbico, ángulo entre la cara hidrofóbica, momento dipolar y GRAVY. Y se cuantificarán parámetros estructurales como: flexibilidad intrínseca y normalizada de cada variante. Se utilizará el servidor PEP- FOLD 3.0 [1], para predecir la estructura tridimensional y generar modelos peptídicos flexibilizados de la(s) mutante(s) [2], se realizará la predicción de la estructura tridimensional ab initio utilizando el algoritmo de inteligencia artificial AlphaFold 2.0 [3].
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