Estudio de la interacción molecular de donadores de óxido nítrico (NO) y donadores de nucleótidos cíclicos con el CNBD del canal HCN
Date
2020-10
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“Los canales HCN (Hyperpolarization-actived Cyclic Nucleotide-gated channels) son proteínas de membrana responsables de la actividad eléctrica de las células excitables. Además, son activados por hiperpolarización y regulados por unión a nucleótidos cíclicos y óxido nítrico (NO). Para estudiar el mecanismo de descomposición del NO es necesario contar con compuestos que liberen NO a los sistemas biológicos. Las sales de diazeniumdiolato (NONOatos) constituyen una clase versátil de donadores de NO y debido a que este mecanismo sigue siendo de interés, en esta tesis se describe el mecanismo de liberación del NO a partir de NONOatos mediante un enfoque teórico basado en la teoría del funcional de la densidad (DFT), para después evaluar los sitios de interacción de los ligantes con el dominio de unión a nucleótido cíclico (CNBD) del canal HCN mediante simulaciones de dinámica molecular. Nuestra propuesta de mecanismo de liberación de NO surge del estudio de protonación en los NONOatos (1-5). Se evaluó el papel del tamaño del sustituyente dialquilamino en la estructura de los NONOatos (15) y se observó que los tautómeros protonados (H1H5) están involucrados en la generación de los productos. Se propuso que el tautómero 1-5-H5, protonado en el nitrógeno del amino del grupo diolato, genera el estado de transición para llevar a cabo el mecanismo.”
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