Análisis bioinformático del resistoma y plasmidoma de genomas de Escherichia coli adherente-invasiva (AIEC)
Date
2023-11
Authors
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Publisher
Benemérita Universidad Autónoma de Puebla
Abstract
"Escherichia coli adherente/invasiva (AIEC) es un patotipo de la enterobacteria E. coli recientemente descrito que se ha visto implicado en el desarrollo de la Enfermedad Inflamatoria Intestinal (EII), debido a su capacidad de invadir a las células intestinales y generar una disbiosis que propicia una respuesta inmunitaria exacerbada. Se tiene poca información sobre la resistencia de AIEC a los antibióticos y la presencia de plásmidos que pudieran diseminar genes de resistencia; por lo que la finalidad de esta tesis fue analizar genomas de AIEC depositados en bases de datos públicas hasta marzo de 2022 para determinar su filogenia, plasmidoma y resistoma. Se analizaron 30 genomas de cepas clasificadas como AIEC en la plataforma (PATRIC) pertenecientes a los filogrupo: B2 (23), B1 (3), A (), D (1) y F (1). Las cepas presentaron más de 40 genes de resistencia por genoma, siendo genes relacionados a bombas de eflujo de antibióticos los más frecuentemente encontrados. De los 30 genomas, 20 presentaron plásmidos, siendo 10 con plásmidos conjugativos, 6 movilizables y 4 no movilizables".
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