Análisis de la expresión diferencial del sistema Rsm en Azotobacter vinelandii en condiciones de fijación de nitrógeno y en presencia de amonio
Date
2025-01-09
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Benemérita Universidad Autónoma de Puebla
Abstract
"En el presente estudio se realizó un análisis bioinformático de un transcriptoma de la cepa DJ de A. vinelandii, establecido bajo 2 condiciones, en un medio Burk sacarosa (Bs) y en un medio Burk sacarosa adicionado con amonio (Bs-NH4 10 mM). Se realizó un análisis de expresión diferencial en el cual se observó el comportamiento de la expresión de los snc-RNA del sistema Rsm y de la proteína RsmA; así como los genes nifHDK, que se sabe son reprimidos en presencia de amonio, sirviendo como grupo control del análisis de datos. Como resultado podemos observar que la presencia de amonio abate la expresión de los snc-RNA del sistema Rsm de la familia RsmZ, mientras que hubo un ligero aumento de la expresión de RsmY. Así mismo, la proteína RsmA se ve expresada en presencia de amonio lo que quiere decir que la presencia o ausencia de amonio influye mucho en la expresión de los genes reguladores rsm, ya que al haber amonio en el medio la bacteria ya no necesita entrar a un estado de fijación de nitrógeno por ende se ve reducida esta expresión".
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