El gen GDI_1248 como regulador transcripcional de zinc en Gluconacetobacter diazotrophicus Pal5
Date
2023-06
Authors
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Publisher
Benemérita Universidad Autónoma de Puebla
Abstract
“Gluconacetobacter diazotrophicus Pal5, es una bacteria endófita. En su genoma se encuentran los genes GDI_1398 y GDI_1248 que codifican para dos proteínas de la superfamilia FUR de las cuales, se ha estudiado e intentado determinar la función de la proteína reguladora GDI_1248 haciendo análisis fenotípicos en la cepa E. coli H1780 pEXP5-CT1248, E. coli H1780 pEXP5CT y E. coli H1780 probando su respuesta ante el estrés oxidativo. Este trabajo tiene la finalidad de analizar y comparar mediante programas bioinformáticos la secuencia aminoacídica del gen GDI_1248 de la cepa G. diazotrophicus Pal5 con las secuencias de reguladores transcripcionales Zur de procariotas de diferentes grupos filogenéticos, y encontrar diferencias en la homología o similitud entre las secuencias analizadas. Para el estudio del gen GDI_1248 de manera experimental se utilizó la cepa E. coli BL21 pLys pEXP5- CT1248, que contenía la construcción GDI_1248 clonada en el vector de expresión pEXP5CT. Se estandarizaron las condiciones óptimas de la expresión de la proteína reguladora GDI_1248 recombinante, la cual fue confirmada mediante inmunodetección con anticuerpos monoclonales anti-polihistidina fosfatasa alcalina. Finalmente, se utilizó la herramienta bioinformática “docking”.
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