Análisis de interacciones entre PhaP4, PhaP5 y PhaP6 y factores σ 24 y σ32 con la región promotora del gen phaC de Azospirillum brasilense Sp7
Date
2023-11
Authors
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Publisher
Benemérita Universidad Autónoma de Puebla
Abstract
"Las fasinas (PhaP) son proteínas anfifílicas involucradas en la regulación de la producción, cantidad y tamaño de los gránulos de polihidroxibutirato (PHB) en Azospirillum brasilense Sp7. se han reportado seis genes codificantes para proteínas fasinas que presentan un dominio Phasin_2, phaP1Abs al phaP6Abs. Existen cuatro tipos de proteínas asociadas a gránulos (GAP´s) de PHB; donde estudios efectuados han sugerido una posible interacción con alguna de las fasinas con el DNA. Las fasinas son proteínas predominantes en el granulo de PHB. No hay suficiente información publicada sobre las fasinas de A. brasilense Sp7. La generación de modelos tridimensionales de las fasinas 4, 5 y 6 y de los factores σ24 y σ32, permitieron realizar el docking molecular de la interacción entre fasina-factor sigma, fasinas-DNA, factor sigma-DNA y complejo proteico-DNA, estos últimos con el fin de evaluar posibles uniones a las probables cajas -10 y -35 río arriba del gen phaC. Las fasinas han demostrado unirse a regiones de los factores sigma que participan en la detección de las cajas -10 y -35, además se observó que podrían evitar la unión de los factores sigma sobre estos motivos promotores, por lo que podrían ocasionar el bloqueo o la promoción de la transcripción".
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