Dilucidación y estudio in silico de la estructura tridimensional de una versión truncada de la levansacarasa LevS de Leuconostoc mesenteroides B512F
Date
2025-05
Authors
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Publisher
Benemérita Universidad Autónoma de Puebla
Abstract
"Actualmente, la base de datos Protein Data Bank (PDB) contiene pocas estructuras cristalográficas de fructansacarasas bacterianas, con solo siete levansacarasas y una inulosacarasa reportadas, siendo esta última la única multidominio. En este contexto, el presente trabajo dilucidó la estructura cristalográfica “LevS N34Tn22” de la enzima truncada LevS N70Tn38 de la levansacarasa Leuconostoc mesenteroides B512F, con una resolución de 2.5 Å, convirtiéndose en la primera estructura cristalográfica de una levansacarasa multidominio. Se identificaron los residuos de la triada catalítica: Asp247 (nucleófilo), Asp399 (estabilizador del estado de transición) y Glu497 (catalizador ácido/base), así como los subsitios de reconocimiento a carbohidrato (-1 al +4), con residuos como Trp246, Arg398, Arg515 y Tyr389. Además, ensayos de acoplamiento molecular revelaron 16 residuos clave en el reconocimiento de carbohidratos, incluyendo Trp311, Glu495 y Tyr586. También se identificaron nueve bucles estructurales del dominio catalítico, destacando los bucles I, IV, VII, VIII y IX, los cuales podrían influir en la síntesis de productos al modificar la topología del sitio catalítico de la levansacarasa LevS, proporcionando así nuevos conocimientos estructurales sobre enzimas GH68 multidominio".
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