Estudio del efecto antagónico de Paraburkholderia sp. GB99 contra hongos patógenos en cultivo de café
Date
2024-10-30
Authors
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Benemérita Universidad Autónoma de Puebla
Abstract
"Dentro del género Burkholderia existe una amplia gama de especies capaces de producir una gran diversidad de metabolitos secundarios con actividad antimicrobiana y antifúngica. Se han reportado varios compuestos como pirrolnitrina, occidiofungina, burkholdines, fenazina entre otros, que desatacan por tener actividad antifúngica contra hongos fitopatógenos que afectan a cultivos de importancia económica como café, maíz, frijol, jitomate, etc. Para corroborar que en efecto los antifúngicos pirrolnitrina y occidiofungina se encuentren a nivel del genoma de la cepa GB99, se realizó el análisis bioinformático conformado por la secuenciación, ensamble del genoma, análisis de calidad del ensamble, búsqueda Blastn de los genes biosintéticos, alineamiento global, búsqueda de conservación de dominios y mapa de los genes biosintéticos. Como parte de los resultados, se corroboro que la cepa GB99 tiene presente los genes biosintéticos con los dominios conservados para la producción del antifúngico occidiofungina. El objetivo es evaluar la actividad antagónica de manera in vitro utilizando los metabolitos secundarios producidos por la cepa Burkholderia sp. GB99 frente a hongos fitopatógenos que afectan el cultivo del café".
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