Estudio computacional de fragmentos simples de ADN con citosinas modificadas en posición 5

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dc.audiencegeneralPublic
dc.contributorDomínguez Benítez, Verónica
dc.contributor.advisorDomínguez Benítez, Verónica; 0009-0009-3822-9488
dc.contributor.authorAcevedo Vázquez, Alejandro
dc.date.accessioned2026-01-14T19:31:22Z
dc.date.available2026-01-14T19:31:22Z
dc.date.issued2025-08
dc.description.abstract"como marca epigenética durante la transcripción de proteínas. Sin embargo, durante el proceso de desmetilación de ésta surgen otras modificaciones intermedias que pueden tener distintas consecuencias y funciones en el genoma. En este trabajo se emplearon métodos de optimización de la geometría molecular, basados en la mecánica molecular y mecánica cuántica, con el objetivo de estudiar las contribuciones de tales modificaciones en la posición 5 de la base nitrogenada citosina a la conformación de distintas subunidades del ADN. Las modificaciones intermedias que participan en el proceso de desmetilación de 5mC incluyen la 5-hidroximetilcitosina (5hmC), 5-formilcitosina (5fC) y 5-carboxilcitosina (5caC). Para ello, se analizaron las características estructurales presentes en tales bases modificadas aisladas, las interacciones presentes en los pares de bases que forman con la base canónica guanina y las posibles conformaciones que pueden adoptar los nucleósidos de tales bases modificadas, además de fragmentos mínimos de la cadena única del ADN. De los cálculos realizados con bases aisladas, empleando métodos DFT y MP2, se encontró la existencia de diversos isómeros estables de estas modificaciones, siendo el isómero más favorable, en cada modificación estudiada, aquél que presentó un enlace por puente de hidrógeno entre el grupo funcional modificado en posición 5 y el grupo amino ya presente en la base canónica citosina. Así mismo, no se observaron cambios significativos estructurales al analizar los pares de bases y los nucleósidos cuando cambiamos la citosina canónica por una modificación en posición 5".
dc.folio20250811092353-7869-T
dc.formatpdf
dc.identificator1
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12371/30873
dc.language.isospa
dc.matricula.creator223470382
dc.publisherBenemérita Universidad Autónoma de Puebla
dc.rights.accesopenAccess
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0
dc.subject.classificationCIENCIAS FÍSICO MATEMÁTICAS Y CIENCIAS DE LA TIERRA
dc.subject.lccFisiología--Bioquímica animal--Sustancias especiales--Sustancias orgánicas--Ácidos nucleicos--Ácidos desoxirribonucleicos--Temas especiales--Metilación
dc.subject.lccADN--Metilación--Investigación
dc.subject.lccÁcido desoxirribonucleico--Estructura--Análisis
dc.subject.lccÁcido desoxirribonucleico--Análisis--Procesamiento de datos
dc.thesis.careerMaestría en Ciencias (Física Aplicada)
dc.thesis.degreedisciplineÁrea de Ingeniería y Ciencias Exactas
dc.thesis.degreegrantorFacultad de Ciencias Físico Matemáticas
dc.thesis.degreetoobtainMaestro (a) en Ciencias (Física Aplicada)
dc.titleEstudio computacional de fragmentos simples de ADN con citosinas modificadas en posición 5
dc.typeTesis de maestría
dc.type.conacytmasterThesis
dc.type.degreeMaestría
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