El Protein Data Bank (PDB) y su impacto en la investigación científica
Date
2022-02-14
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El Protein Data Bank (banco de datos de proteínas), abreviado como PDB, es el banco de información estructural de proteínas a nivel atómico, donde están depositadas todas las estructuras tridimensionales de las macromoléculas biológicas determinadas por la comunidad científica mundial y que incluye a proteínas, ácidos nucleicos, carbohidratos y lípidos. Su uso es libre y hasta noviembre del 2021 tiene 184,202 estructuras depositadas. La mayor parte de la información tridimensional con la que cuenta el PDB con respecto a las biomoléculas es la referente a proteínas con 158,644 estructuras depositadas y la técnica más utilizada para la determinación de las estructuras es la difracción de rayos X con 161,144 estructuras depositadas. En este año, el PDB cumple 50 años y la información que nos proporciona ha revolucionado la visión que teníamos sobre los procesos biológicos a nivel atómico. El PDB es una enorme base de datos de estructuras y una fuente de información importante sobre diversas macromoléculas, las cuales pueden ser analizadas por una diversidad de profesionales como: cristalógrafos, químicos, biólogos, bioquímicos, microbiólogos, médicos, farmacéuticos, entre otros. El conocer la estructura de una macromolécula de interés puede ayudar a entender una gran cantidad de procesos químicos, biológicos y enfermedades, ya que entender a detalle atómico la alteración química y estructural de una macromolécula permite descifrar los mecanismos que participan en el proceso químico o biológico de estudio o en una enfermedad y el daño en el organismo; además se puede realizar el diseño de fármacos para su tratamiento.
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