Análisis de la relación clonal e identificación de genes asociados a resistencia a rifaximina o producción de serin-betalactamasas a través de la secuenciación del genoma completo en cepas de Escherichia coli aisladas de biopsias de pacientes con enfermedad inflamatoria intestinal

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dc.audiencegeneralPublic
dc.contributorRocha Gracia, Rosa del Carmen
dc.contributorBalbuena Alonso, María Guadalupe
dc.contributor.advisorBALBUENA ALONSO, MARIA GUADALUPE; 589143
dc.contributor.authorIbarra Moreno, Luis Mario
dc.date.accessioned2025-11-04T18:22:41Z
dc.date.available2025-11-04T18:22:41Z
dc.date.issued2025-06
dc.description.abstract"Este estudio analiza la Enfermedad Inflamatoria Intestinal (EII) en México y su relación con Escherichia coli, específicamente el patotipo Adherente/Invasivo (AIEC), destacando cepas resistentes a rifaximina y betalactámicos, lo que complica el tratamiento. Se analizaron 16 cepas de un paciente con Colitis Ulcerosa Crónica Indeterminada (CUCI), 19 de un paciente con Colitis Crónica y Diverticulitis, y una de un paciente con CUCI. La relación clonal se determinó mediante Electroforesis en Gel de Campos Pulsados (PFGE) y la secuenciación genómica de seis cepas mediante MinION Nanopore 100x. Se identificaron mutaciones en rpoB asociadas a resistencia a rifaximina, genes de serin-betalactamasas y factores de virulencia AIEC, comparándolos con genomas de bases públicas. Las cepas de los pacientes uno y tres pertenecieron al filogrupo A, y las del paciente dos al filogrupo F. Cepas productoras de BLEE del paciente uno se agruparon en seis clados, y las resistentes a rifaximina de los pacientes dos y tres en nueve. Los genes blaTEM, blaOXA, blaCTX-M y blaCTX-M15 predominaron en el paciente uno, mientras que las cepas del paciente dos presentaron mutaciones S574Y y Q513L en rpoB y genes de virulencia chuA y ratA. La diversidad filogenética y la agrupación por origen reflejan la complejidad genética de E. coli AIEC. Se concluye que el monitoreo epidemiológico en México es fundamental para comprender la diversidad genética de bacterias vinculadas a EII y su potencial clínico y ambiental".
dc.folio20250619141958-4941-TL
dc.formatpdf
dc.identificator3
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12371/30175
dc.language.isospa
dc.matricula.creator201951540
dc.publisherBenemérita Universidad Autónoma de Puebla
dc.rights.accesopenAccess
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0
dc.subject.classificationMEDICINA Y CIENCIAS DE LA SALUD
dc.subject.lccMedicina interna--Especialidades de medicina interna--Enfermedades del sistema digestivo--Enfermedades de los intestinos--Otras enfermedades--Enfermedades inflamatorias intestinales
dc.subject.lccBiología (General)--Genética--Obras generales, tratados y manuales--Genética microbiana (General)
dc.subject.lccMicrobiología--Bacterias--Antibiosis--Resistencia
dc.subject.lccEnfermedades inflamatorias intestinales--Aspectos moleculares
dc.subject.lccGenética bacteriana--Análisis
dc.thesis.careerLicenciatura en Biomedicina
dc.thesis.degreedisciplineÁrea de Ciencias Naturales y de la Salud
dc.thesis.degreegrantorFacultad de Medicina
dc.thesis.degreetoobtainLicenciado (a) en Biomedicina
dc.titleAnálisis de la relación clonal e identificación de genes asociados a resistencia a rifaximina o producción de serin-betalactamasas a través de la secuenciación del genoma completo en cepas de Escherichia coli aisladas de biopsias de pacientes con enfermedad inflamatoria intestinal
dc.typeTesis de licenciatura
dc.type.conacytbachelorThesis
dc.type.degreeLicenciatura
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