Análisis de genómica comparativa entre cepas de Clostridioides difficile aisladas en México y de otras partes del mundo
Date
2024-01
Authors
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Publisher
Benemérita Universidad Autónoma de Puebla
Abstract
"La infección por Clostridioides difficile (ICD) plantea un desafío significativo para la salud pública a nivel mundial, dando origen a brotes de diarrea vinculados al uso de antibióticos y colitis pseudomembranosa en entornos clínicos. La prevalencia de cepas epidémicas, como la RT027/ST01, caracterizada por su alta virulencia y resistencia a antibióticos, ha experimentado un aumento global, alcanzando una notoria prevalencia del 63% en México. El presente trabajo tuvo como objetivo realizar un análisis de las características genómicas, filogenéticas y patogénicas de cepas aisladas en Puebla, México. Para esto, se recolectaron 93 muestras fecales de pacientes de un hospital privado en Puebla entre junio de 2022 y enero de 2023, a partir de las cuales se aislaron y tipificaron 16 cepas de C. difficile mediante PCR. Posteriormente se evaluó la susceptibilidad a antibióticos mediante concentración mínima inhibitoria (CMI) y se llevó a cabo la Secuenciación del Genoma Completo (WGS) de 9 cepas. La comparación de estas cepas con otros genomas de México (75 genomas) y de otros países (74 genomas) provenientes de bases de datos públicas permitió realizar la clasificación y análisis filogenético basado en Tipificación Multilocus de Secuencias (MLST)".
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