Análisis de genómica comparativa entre cepas de Clostridioides difficile aisladas en México y de otras partes del mundo

dc.audiencegeneralPublic
dc.contributorClaudia Fabiola Martínez de la Peña
dc.contributor.advisorMARTINEZ DE LA PEÑA, CLAUDIA FABIOLA; 91993
dc.contributor.authorGuzmán Ortiz Flores, Charlen
dc.date.accessioned2024-05-31T20:27:51Z
dc.date.available2024-05-31T20:27:51Z
dc.date.issued2024-01
dc.description.abstract"La infección por Clostridioides difficile (ICD) plantea un desafío significativo para la salud pública a nivel mundial, dando origen a brotes de diarrea vinculados al uso de antibióticos y colitis pseudomembranosa en entornos clínicos. La prevalencia de cepas epidémicas, como la RT027/ST01, caracterizada por su alta virulencia y resistencia a antibióticos, ha experimentado un aumento global, alcanzando una notoria prevalencia del 63% en México. El presente trabajo tuvo como objetivo realizar un análisis de las características genómicas, filogenéticas y patogénicas de cepas aisladas en Puebla, México. Para esto, se recolectaron 93 muestras fecales de pacientes de un hospital privado en Puebla entre junio de 2022 y enero de 2023, a partir de las cuales se aislaron y tipificaron 16 cepas de C. difficile mediante PCR. Posteriormente se evaluó la susceptibilidad a antibióticos mediante concentración mínima inhibitoria (CMI) y se llevó a cabo la Secuenciación del Genoma Completo (WGS) de 9 cepas. La comparación de estas cepas con otros genomas de México (75 genomas) y de otros países (74 genomas) provenientes de bases de datos públicas permitió realizar la clasificación y análisis filogenético basado en Tipificación Multilocus de Secuencias (MLST)".
dc.folio20240202103454-9938-T
dc.formatpdf
dc.identificator2
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/20.500.12371/20632
dc.language.isospa
dc.matricula.creator221470355
dc.publisherBenemérita Universidad Autónoma de Puebla
dc.rights.accesopenAccess
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0
dc.subject.classificationBIOLOGÍA Y QUÍMICA
dc.subject.lccInfecciones nosocomiales
dc.subject.lccDiarrea--Microbiologia
dc.subject.lccBacterias patógenas
dc.subject.lccGenética bacteriana
dc.subject.lccVirulencia (Microbiología)
dc.subject.lccResistencia a los medicamentos en los microorganismos
dc.thesis.careerMaestría en Ciencias (Microbiología)
dc.thesis.degreedisciplineÁrea de Ciencias Naturales y de la Salud
dc.thesis.degreegrantorInstituto de Ciencias
dc.thesis.degreetoobtainMaestro(a) en Ciencias (Microbiología) con opción en Microbiología Médica
dc.titleAnálisis de genómica comparativa entre cepas de Clostridioides difficile aisladas en México y de otras partes del mundo
dc.typeTesis de maestría
dc.type.conacytmasterThesis
dc.type.degreeMaestría
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