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Tesis Aislamiento e identificación de cepas fúngicas de Stanhopea tigrina productoras de giberelinas con efecto benéfico para la orquídea(Benemérita Universidad Autónoma de Puebla, 2018-01) Salazar Cerezo, Sonia; SALAZAR CEREZO, SONIA; 360912; MARTINEZ CONTRERAS, REBECA DEBORA; 84940"La familia Orchidaceae es una de las familias de plantas más ricas en especies. Su valor comercial y hortícola y los usos etnobotánicos han fascinado por mucho tiempo a la humanidad. México posee una notable riqueza de orquídeas, de las cuales alrededor del 40% son endémicas. Sin embargo, la supervivencia de estas especies endémicas se ve amenazada por la extracción de orquídeas de su hábitat natural, la ampliación de los asentamientos humanos y la explotación de sus hábitats. Stanhopea tigrina es una especie endémica reportada en la NOM-059-SEMARNAT-2010 como una especie amenazada, la cual posee una relevancia cultural, biológica y económica para México y Puebla. Si bien se ha establecido que las asociaciones simbióticas entre las orquídeas y los hongos son esenciales para la planta con el fin de sobrevivir durante las etapas críticas de desarrollo, los microorganismos naturales presentes en S. tigrina no se conocen. La identificación de cepas fúngicas en S. tigrina con la capacidad de producir diferentes metabolitos podría ser útil para el establecimiento de interacciones benéficas destinadas a mejorar las etapas de desarrollo tempranas para facilitar la supervivencia de esta especie. Con este fin, se realizó la identificación fenotípica y genotípica de aislados fúngicos recuperados de las orquídeas de S. tigrina. Además, de examinar la capacidad de los aislados para producir giberelinas. Con este trabajo, se pretende contribuir al conocimiento de la diversidad fúngica asociada a S. tigrina a la vez identificar aislados fúngicos con la capacidad de producir giberelinas como primer intento de encontrar estrategias que nos permitan revertir el estado de amenaza de esta orquídea."Tesis de doctorado Aislamiento e identificación de cepas fúngicas de Stanhopea tigrina productoras de giberelinas con efecto benéfico para la orquídea(Benemérita Universidad Autónoma de Puebla, 2018-01) Salazar Cerezo, Sonia; SALAZAR CEREZO, SONIA; 360912“La familia Orchidaceae es una de las familias de plantas más ricas en especies. Su valor comercial y hortícola y los usos etnobotánicos han fascinado por mucho tiempo a la humanidad. México posee una notable riqueza de orquídeas, de las cuales alrededor del 40% son endémicas. Sin embargo, la supervivencia de estas especies endémicas se ve amenazada por la extracción de orquídeas de su hábitat natural, la ampliación de los asentamientos humanos y la explotación de sus hábitats. Stanhopea tigrina es una especie endémica reportada en la NOM-059-SEMARNAT-2010 como una especie amenazada, la cual posee una relevancia cultural, biológica y económica para México y Puebla. Con este fin, se realizó la identificación fenotípica y genotípica de aislados fúngicos recuperados de las orquídeas de S. tigrina. Además, de examinar la capacidad de los aislados para producir giberelinas. Con este trabajo, se pretende contribuir al conocimiento de la diversidad fúngica asociada a S. tigrina a la vez identificar aislados fúngicos con la capacidad de producir giberelinas como primer intento de encontrar estrategias que nos permitan revertir el estado de amenaza de esta orquídea”.Tesis de doctorado Análisis bioinformático de bacteriocinas en el género Burkholderia y desarrollo de una herramienta de análisis masivo de datos de secuencias(2018-08) Pedraza Pérez, Yagul; PEDRAZA PEREZ, YAGUL; 103801; FUENTES RAMIREZ, LUIS ERNESTO; 14072"En este trabajo se presenta una nueva estrategia de visualización que permite desplegar, de una manera intuitiva, una gran cantidad de resultados de blast en genomas bacterianos completamente secuenciados. Los replicones bacterianas circulares son proyectadas como líneas horizontales con longitud fija de 360, que son los grados que tiene un círculo, y un sistema de coordenadas x; y fue creado, en donde el eje-x representa la longitud del replicón y el eje-y la cantidad de replicones usados. Cuando una secuencia de búsqueda coincide con un gen/proteína de un replicón particular, el resultado de blast es representado como un vector con origen en la posición x; y, magnitud proporcional a su longitud real y una dirección acorde al sentido de transcripción".Tesis de doctorado Análisis de la expresión diferencial de genes involucrados en el retorno del estado viable no cultivable de P. putida KT2440 posterior a la rehidratación(2020-12) López Lara, Lilia Isela; LOPEZ LARA, LILIA ISELA; 453869; BAEZ ROGELIO, ANTONINO; 49619; QUINTERO HERNANDEZ, VERONICA; 121786"En el presente estudio se exploró la supervivencia de Pseudomonas putida KT2440 a la desecación ambiental y su posterior rehidratación. Se encontró que es una bacteria poco tolerante a desecación, debido a que 15 días después del inicio de la desecación pierde la viabilidad. Anteriormente, se estableció que P. putida KT2440 entra en estado viable no cultivable (VBNC) como estrategia de supervivencia a la desecación y recupera la viabilidad cuando las células son rehidratadas por un periodo de 24 horas. El análisis transcriptómico de células desecadas 18 días y rehidratadas 20 minutos y células desecadas 18 días y rehidratadas 24 horas comparado con células no desecadas reveló genes potencialmente involucrados en el retorno del estado VBNC. Se determinó que la activación de los procesos de transporte, a través del receptor dependiente de TonB (PP_1446) para la captación de sideróforos y el sistema de transporte de alcoholes de cadena media (PP_2662 y PP_2676) contribuyen a ciertas funciones en el estado VBNC de P. putida KT2440. No obstante, la interrupción del gen PP_1446 incrementó la supervivencia de la cepa mutante."Tesis de doctorado Análisis de la expresión y funcionalidad del gen cdgD, que codifica una proteína híbrida de A. brasilense Sp 245(Benemérita Universidad Autónoma de Puebla, 2021-06) Cruz Perez, Jose Francisco; CRUZ PEREZ, JOSE FRANCISCO; 539487; RAMIREZ MATA, ALBERTO; 43483; BACA, BEATRIZ EUGENIA; 33727"Azospirillum brasilense es una bacteria fijadora de nitrógeno, la cual ha sido empleada como un inoculante bacteriano en todo el mundo, por su efecto benéfico sobre las plantas hospederas como maíz, trigo, sorgo, arroz entre otras. Debido a múltiples mecanismos, los cuales se proponen son los responsables de generar un mejor estado nutricional de las plantas, estos mecanismos incluyen efectos directos sobre el metabolismo vegetal, al aportar nutrientes (hierro, fósforo y nitrógeno) y sintetizar moléculas con actividad de fitohormonas (auxinas, citoquininas, giberelinas, óxido nítrico), o efectos indirectos como un antagonismo frente a fitopatógenos y un aumento de la resistencia a patógenos. Para ello, la bacteria debe de contener una serie de genes que participen en el control de una colonización exitosa de la raíz de la planta, como lo son la quimiotaxis y la formación de biopelícula. En este estudio analizamos la expresión y función del gen cdgD. Este gen se expresa tanto en bacterias que crecen en condiciones planctónicas, como en condiciones de formación de biopelícula, lo cual fue determinado por ensayos de qRT-PCR. Además se observó una expresión diferencial del gen cdgD cuando se agregó al medio mínimo fuentes de nitrógeno diferentes (nitrato de potasio o cloruro de amonio)".Tesis de doctorado Análisis de los genes que codifican a la diguanilato ciclasa C y la fosfohidrolasa putativa tipo NUDIX de Azospirillum baldaniorum Sp245(Benemérita Universidad Autónoma de Puebla, 2022-01) Sierra Cacho, Daniel; SIERRA CACHO, DANIEL; 689996; BACA, BEATRIZ EUGENIA; 33727"El di-GMPc es un segundo mensajero distribuido en múltiples géneros bacterianos. Esta molécula es capaz de regular múltiples actividades celulares entre las que destacan la formación de biopelícula, movilidad, quimiotaxis, ciclo celular y virulencia bacteriana. En el caso de las rizobacterias promotoras del crecimiento vegetal (PGPRs) se ha descrito que el papel que desempaña el di-GMPc es de vital importancia en la interacción bacteria-planta. A pesar de la relevancia de este mensajero, los reportes de la regulación mediada por éste en la bacteria A. baldaniorum Sp245 son escasos, por lo que la información que brinde este trabajo permitirá una mayor comprensión del metabolismo de esta molécula así como la probable asociación que pudiese presentar el di-GMPc con las enzimas de tipo NUDIX, las cuales no han sido descritas en el modelo de estudio. En este trabajo se evalúo experimentalmente la función del gen cdgC de A. baldaniorum Sp245, el cual codifica para una proteína con función de diguanilato ciclasa".Tesis de doctorado Análisis genético del activador transcripcional PerA durante la activación de los operones bfp y per en Escherichia coli enteropatógena(2015) García Zacarías, Claudia María; MARTINEZ LAGUNA, YGNACIO; 33726; PUENTE GARCIA, JOSE LUIS; 7470"Esta investigación comprende la caracterización, en Escherichia coli Enteropatogena, de mutantes en el activador transcripcional PerA, que posiblemente participen en interacción con la RNA polimerasa; así como, mutantes de las subunidades alfa y sigma de la RNA polimerasa, que intervengan en la interacción mencionada, durante la activación de los operones bfp y per. Se realizaron ensayos de actividad transcripcional, mediante el sistema indicador del cloranfenicol acetil transferasa, para medir el nivel de expresión de los promotores bfpA y perA. Inicialmente en presencia de mutantes en PerA, se seleccionaron aquellas mutantes que redujeron considerablemente la expresión de uno o ambos promotores. Las mutantes seleccionadas se fusionaron a la proteína de unión a maltosa y se purificaron por cromatografía de afinidad, para examinar su capacidad de unión a las regiones reguladoras perA y bfpA mediante ensayos de cambio en la movilidad electroforética; demostrando que los residuos E116 y D168 muestran actividad diferencial durante la activación de los promotores bfpA y perA".Tesis de doctorado Análisis molecular del antagonismo microbiano de Burkholderia Gladioli(Benemérita Universidad Autónoma de Puebla, 2019-11) Seynos Garcia, Eduardo; SEYNOS GARCIA, EDUARDO; 363506; FUENTES RAMIREZ, LUIS ERNESTO; 14072"El uso de pesticidas químicos utilizados para erradicar microorganismos patógenos de cultivos se ha convertido en un problema emergente por su gran capacidad de contaminación del ambiente y su alta toxicidad para el hombre. Debido a estos efectos secundarios, se ha propuesto al control biológico como una alternativa. En la búsqueda de microorganismos antagonistas contra T. ptyseos al agente causal de la enfermedad Pink disease de piña se detectó a B. gladioli UAPS07070 como un agente potencial de biocontrol. Por ensayos in vitro y extracción por HPLC (cromatografía líquida de alta eficiencia, por sus siglas del inglés) se dedujo que esta bacteria produce uno o varios metabolitos capaces de inhibir a una amplia variedad de microorganismos, los compuestos aún no han sido purificados y caracterizados. A la fecha no se conocen las vías involucradas en el efecto antagónico producido por B. gladioli hacia otros microorganismos. De ahí el interés de iniciar el conocimiento a nivel molecular de la síntesis y caracterización del compuesto."Tesis de doctorado Bacillus cereus MH778713 asiste a la fitorremediación a Prosopis laevigata mediante la producción de compuestos orgánicos volátiles(Benemérita Universidad Autónoma de Puebla, 2019-12) Ramírez Falcón, Verónica Liliana; RAMIREZ FALCON, VERONICA LILIANA; 457512; BAEZ ROGELIO, ANTONINO; 49619; MUNIVE HERNANDEZ, JOSE ANTONIO; 30150"Las plantas son capaces de entablar una estrecha comunicación entre ellas y con bacterias que se encuentran presentes en determinado nicho ecológico cuando estas producen compuestos orgánicos volátiles (COVs), los cuales son considerados como desencadenantes de una cascada de señalización en las plantas, este proceso esta directamente relacionado con el desarrollo de la raíz, el desarrollo de la planta, la regulación hormonal, la obtención de nutrientes, la inducción de la respuesta sistémica y la producción de compuestos antifúngicos."Tesis de doctorado Caracterización de la resistencia antimicrobiana y tipificación molecular de cepas de Escherichia coli aisladas de diferentes hospederos en Puebla, México(Benemérita Universidad Autónoma de Puebla, 2016-12) Cortés Cortés, Gerardo; CORTES CORTES, GERARDO; 335026; ROCHA GRACIA, ROSA DEL CARMEN; 60709; LOZANO ZARAIN, PATRICIA; 234468"La emergencia y diseminación clonal de Escherichia coli multidrogo resistentes entre diferentes hospederos es un problema preocupante de Salud Pública que involucra varios compartimentos ambientales. Los mecanismos de resistencia mediados por elementos genéticos móviles como plásmidos e integrones, están incrementando las tasas de multirresistencia en esta bacteria simbiótica. Los objetivos de este trabajo fueron caracterizar los mecanismos de resistencia a diferentes familias de antimicrobianos, analizar los determinantes plasmídicos involucrados en el mantenimiento y la propagación de genes de resistencia, así como determinar el tipado molecular de cepas de E. coli aisladas de perros, tortugas y humanos en la Ciudad de Puebla, México. Se identificaron un total de 43 cepas de E. coli cefotaxima resistentes (CTXR) a partir de pacientes pediátricos (11/26, 42%), voluntarios sanos (11/60, 18%), perros (10/53, 17%) y tortugas (11/71, 15.5%). También se identificaron mutaciones en la región reguladora ampC (resistencia a β-lactámicos) y en los genes cromosómicos gyrA y parC (resistencia a quinolonas). Algunos determinantes de resistencia fueron transferidos horizontalmente mediante ensayos de conjugación, siendo las β-lactamasas CTX-M-15 y CMY- 2 las más diseminadas en replicones plasmídicos tipo FIA, FIB o I1 de diferentes tamaños. También se identificaron diversos sistemas de adicción plasmídicos, siendo pemKI, ccdAB, hoksok, srnBC, vagCD, pndAC, relB y parDE los más prevalentes".Tesis de doctorado Caracterización de plásmidos portadores de carbapenemasas y estudio del resistoma de aislados clínicos de P. aeruginosa(Benemérita Universidad Autónoma de Puebla, 2023-12) Gómez Martínez, Jessica; GOMEZ MARTINEZ, JESSICA; 613250; LOZANO ZARAIN, PATRICIA; 234468; ROCHA GRACIA, ROSA DEL CARMEN; 87723"Las Infecciones Asociadas a la atención sanitaria son causadas por diversos microorganismos del grupo ESKAPE, el cual incluye a Pseudomonas aeruginosa, quien además de tener resistencia intrínseca a diferentes antibióticos, ha adquirido resistencia a todos los antimicrobianos mediante mutaciones y por trasferencia horizontal de genes; esto incluye a los carbapenémicos que son usados como última elección terapéutica frente a infecciones por este microorganismo. Las IAAS causadas por P. aeruginosa multidrogorresistentes- resistentes a carbapenémicos (MDR-RC) conlleva a un incremento en las estancias hospitalarias, elevados costos para el sistema de salud e incremento en las tasas de morbilidad y mortalidad. Hoy en día gracias a los avances en las tecnologías de secuenciación y al fácil acceso a los mismos, se ha podido conocer el genoma completo y algunas secuencias de plásmidos portadores de carbapenemasas de P. aeruginosa, sin embargo, en México no se han realizado este tipo de estudios, por lo que es de gran importancia realizarlos con la finalidad de contribuir en el conocimiento epidemiológico del comportamiento en la distribución mundial de estos elementos genéticos móviles, presentes en esta bacteria. El objetivo de este estudio fue caracterizar plásmidos portadores de carbapenemasas y estudiar el resistoma de aislados clínicos de P. aeruginosa".Tesis de doctorado Caracterización del locus ter1 y perfil de expresión transcripcional de la cepa parental 518 y mutantes Δter1 de Ustilago maydis(Benemérita Universidad Autónoma de Puebla, 2023-06) Sanpedro Luna, Juan Antonio“La telomerasa es una ribonucleoproteína con actividad transcriptasa reversa que cataliza la síntesis de novo del repetido telomérico en los extremos lineales de los cromosomas eucarióticos. Sus componentes centrales son la subunidad proteica TERT (Telomerase Reverse Transcriptase) y la subunidad de ARN conocida como TER (Telomerase RNA). Hasta el momento se conoce con mucho detalle la importancia de la telomerasa para mantener los extremos de los cromosomas en varios organismos, tanto superiores como inferiores. Los telómeros son complejos núcleoproteicos que se localizan en los extremos de los cromosomas eucarióticos lineales que actúan como capucha protectora para prevenir su reconocimiento como rupturas de doble cadena por la maquinaria de repuesta al daño del ADN (DDR) por lo que desempeñan un papel central en el mantenimiento de la integridad del genoma, al prevenir eventos de degradación y fusión de los extremos cromosomales (Blackburn, 1994; Cross et al., 1989). Caracterizar el locus ter1 en la cepa 518 de U. maydis y analizar los perfiles de expresión transcripcional de la cepa silvestre 518 y mutantes ter1::hph de U. maydis”.Tesis de doctorado Caracterización genética y funcional de proteínas fasina probables de Azospirillum brasilense Sp7(Benemérita Universidad Autónoma de Puebla, 2019-12) Martínez Martínez, María de los Ángeles; MARTINEZ MARTINEZ, MARIA DE LOS ANGELES; 635183; MARTINEZ MORALES, LUIS JAVIER; 55539"Azospirillum brasilense, uno de los principales microorganismos promotores del crecimiento vegetal, produce grandes cantidades del biopolímero Polihidroxibutirato (PHB) ante condiciones de desbalance nutricional caracterizado por una alta relación C:N. Algunos de los genes involucrados en el metabolismo del PHB han sido previamente estudiados. Sin embargo, no se ha reportado información alguna sobre fasinas, las proteínas anfipáticas involucradas en la estabilización de los carbonosomas en el citoplasma, por lo que el objetivo de este trabajo fue caracterizar genética y funcionalmente la fasina PhaP1 de A. brasilense Sp7. Mediante análisis bioinformáticos fue posible identificar seis genes que codifican para proteínas con probable función de fasina. De estos, la deleción del gen phaP1 (AMK58_RS17065) resultó en la disminución del número de carbonosomas con aumento de tamaño, sugiriendo que la fasina PhaP1 está involucrada en el control de la morfología de los gránulos de PHB cuando se utiliza un medio de cultivo adicionado con ácido málico y cloruro de amonio con una relación C:N de 30:1. Por otro lado, se analizó la acumulación de PHB en la cepas silvestre y mutante, observando que PhaP1 está involucrada también, en el metabolismo del PHB a tiempos cortos, probablemente mediante su interacción con PhbC o PhbZ."Tesis de doctorado Caracterización molecular de rasgos de virulencia en aislados de Avibacterium paragallinarum, con el apoyo de la comparación de genomas(Benemérita Universidad Autónoma de Puebla, 2023-06) Cobos Justo, María Elena; VAZQUEZ CRUZ, CANDELARIO; 33878“La coriza infecciosa (CI) es una enfermedad cosmopolita, que puede causar pérdidas económicas importantes en países dedicados a la producción de huevo y carne de pollo. México es uno de ellos y para hacer frente a la enfermedad es importante combatir eficientemente al agente causal: la bacteria Avibacterium paragallinarum, modelo de estudio en la presente investigación. Para prevenir la CI, están disponibles las vacunas elaboradas con bacterias atenuadas. Sin embargo, se ha observado protección incompleta, pues existen diferentes serovariedades de A. paragallinarum que aparecen subsecuentemente en la cadena productiva de las granjas, con frecuentes reinfecciones de CI por falta de memoria inmunológica. Por tanto, es necesario recurrir a la antibioterapia y vigilar el comportamiento de resistencia y sensibilidad al tratamiento. El objetivo de este trabajo fue identificar los factores de virulencia de cepas de A. paragallinarum de reciente aislamiento, para comprender mejor el proceso patogénico de la CI. Para ello se hizo la secuenciación de los genomas con tecnología de nueva generación y la anotación pormenorizada de los genes, de acuerdo a la tendencia tecnológica actual”.Tesis de doctorado CdgB es una proteína hibrida (GGDEF y EAL) localizada en la membrana citoplasmática de Azospirillum baldaniorum Sp245(Benemérita Universidad Autónoma de Puebla, 2023-02) Viruega Gongora, Victor Ivan; VIRUEGA GONGORA, VICTOR IVAN; 686604; RAMIREZ MATA, ALBERTO; 43483"Azospirillum baldaniorum Sp245 es una rizobacteria promotora del crecimiento de las plantas, puede formar biopelículas a través de un proceso controlado por el segundo mensajero: el ácido di (3´-5´) guanosin monofosfato (diGMPc). En el genoma de A. baldaniorum están codificadas una amplia variedad de proteínas potencialmente involucradas en el control de la concentración intracelular del diGMPc, muchas de las cuales están acopladas a dominios sensoriales que podrían estar involucrados en el establecimiento de una relación mutualista con el hospedero. En este trabajo, se presenta el análisis in silico y la caracterización funcional del gen cdgB (AZOBR_p410089), que codifica para una proteína multidominio MHYT-PAS-GGDEF-EAL de A. baldaniorum Sp245. CdgB se comporta predominantemente como una fosfodiesterasa especifica de diGMPc en A. baldaniorum Sp245, ya que inhibe la formación de biopelícula, la producción de sustancias poliméricas extracelulares (SPE) y promueve la motilidad natatoria. En resumen, nuestros resultados sugieren que CdgB podría influir sobre mecanismos de señalización que controlan los estilos de vida móvil y sésil en respuesta a señales ambientales en donde se desarrolla normalmente A baldaniorum Sp245".Tesis Diseño de inoculante de segunda generación tolerante a condiciones de desecación(Benemérita Universidad Autónoma de Puebla, 2017-12) Molina Romero, Dalia; MOLINA ROMERO, DALIA; 43375; MUÑOZ ROJAS, JESUS; 89650; CASTAÑEDA LUCIO, MIGUEL; 21622Las bacterias que forman parte de la rizósfera y tienen la capacidad de generar un efecto benéfico sobre el crecimiento de las plantas son definidas como Rizobacterias Promotoras del Crecimiento Vegetal (PGPR por sus siglas en inglés) (Vacheron et al. 2013). Se ha documentado que las PGPR pueden beneficiar a las plantas a través de diversos mecanismos que favorecen a la planta de forma directa e indirecta, de acuerdo a esta característica se han clasificado a los mecanismos de promoción de crecimiento vegetal en dos grupos (Fibach-Paldi, Burdman, and Okon 2012; Rojas-Tapias et al. 2012): los que realizan un efecto benéfico directo y los que realizan un efecto indirecto. Las bacterias con mecanismos de efecto benéfico directo, proporcionan nutrientes en formas absorbibles. Por ejemplo las rizobacterias fitoestimuladoras proporcionan nutrientes como fosfatos y nitrógeno, mediante procesos como la fijación biológica de nitrógeno o la solubilización de fosfatos (Saleem et al. 2007).Tesis Diversidad bacteriana metilotrófica asociada a la cactácea neobuxbaumia macrocephala, endémica en riesgo de la reserva Tehuacán Cuicatlán(Benemérita Universidad Autónoma de Puebla, 2017-08) Bustillos Cristales, María del Rocío; BUSTILLOS CRISTALES, MARIA DEL ROCIO; 43102; FUENTES RAMIREZ, LUIS ERNESTO; 14072"Los microorganismos metilotróficos desempeñan un papel importante en múltiples ecosistemas así como en áreas de interés humano debido a su diversidad, sus vías metabólicas únicas en la naturaleza, así como su capacidad para asimilar y oxidar sustratos de bajo costo. Las bacterias metilotróficas utilizan como fuente de energía y de carbono compuestos reducidos en carbono que no tienen enlaces C-C. Estos microorganismos tienen una distribución amplia que incluye suelos, ambientes acuáticos y plantas. Este trabajo se planteó con el propósito de obtener conocimiento de la diversidad microbiana metilotrófica cultivable del ambiente de la cactácea neobuxbaumia macrocephala."Tesis de doctorado Diversidad bacteriana metilotrófica asociada a la cactácea Neobuxbaumia macrocephala, endémica en riesgo de la reserva Tehuacán Cuicatlán(2017-08) Bustillos Cristales, María del Rocío; BUSTILLOS CRISTALES, MARIA DEL ROCIO; 43102; Fuentes Ramírez, Luis Ernesto"Los microorganismos metilotróficos desempeñan un papel importante en múltiples ecosistemas, así como en áreas de interés humano debido a su diversidad, sus vías metabólicas únicas en la naturaleza, así como su capacidad para asimilar y oxidar sustratos de bajo costo. Las bacterias metilotróficas utilizan como fuente de energía y de carbono compuestos reducidos en carbono que no tienen enlaces C-C. Estos microorganismos tienen una distribución amplia que incluye suelos, ambientes acuáticos y plantas".Tesis de doctorado Efecto de las oncoproteínas E6 y E7 del VPH18 sobre la expresión de glicanos y genes de la glicosilación(2018-10) Aco Tlachi, Miguel Angel; ACO TLACHI, MIGUEL ANGEL; 364279; VALLEJO RUIZ, VERONICA; 25668; CARREÑO LOPEZ, RICARDO; 31195"El cáncer cérvicouterino (CaCu) es el segundo tipo de cáncer más común en mujeres en países en vías de desarrollo, incluido México, representando un problema importante de salud pública. Los virus del papiloma humano (VPH) de alto riesgo son los agentes etiológicos del CaCu, el VPH18, tiene mayor prevalencia en adenocarcinoma cervical. El genoma del VPH codifica para dos proteínas virales E6 y E7 con alta capacidad oncogénica y que son esenciales para el desarrollo del fenotipo maligno, al interaccionar con diversas proteínas que regulan la homeostasis celular e inducir cambios globales en la expresión génica hospedera. Alteraciones a nivel de la glicosilación están íntimamente ligadas a la carcinogénesis; se ha observado expresión aberrante de glicanos de superficie celular y de los genes responsables de su biosíntesis en diversos tipos de cáncer, afectando el comportamiento tumoral. En la actualidad poco se sabe acerca de alteraciones de la glicosilación en CaCu. El objetivo de este trabajo fue evaluar si E6 y E7 del VPH18 afectan la expresión de glicogenes y estructuras glicánicas."Tesis de doctorado Ensamble de la secuencia genómica de la bacteria Avibacterium paragallinarum cepas CL y 2015, para analizar algunos determinantes genéticos relacionados con la virulencia(Benemérita Universidad Autónoma de Puebla, 2018-02) Horta Valerdi, Guillermo Manuel; HORTA VALERDI, GUILLERMO MANUEL; 263595; VAZQUEZ CRUZ, CANDELARIO; 33878; NEGRETE ABASCAL, ERASMO; 15045"Avibacterium paragallinarum es el agente etiológico de la coriza infecciosa, una enfermedad del tracto respiratorio superior de pollos y gallinas, caracterizada por producir descarga nasal, estornudo e inflamación facial. La distribución de esta enfermedad es mundial y causa importantes pérdidas económicas a la industria avícola debido al retraso del crecimiento, pérdida de peso, y disminución de la producción de huevo. Existen tres serogrupos (A, B y C) y 9 serotipos de esta bacteria. Debido a esta variedad de cepas, y variabilidad entre ellas, no existe un control adecuado de la enfermedad que ocasiona. En el grupo de trabajo de microbiología molecular y celular del ICUAP, consideramos que la enfermedad y la forma en que la bacteria desarrolla la patología, podrían ser comprendidas de mejor manera si se contara con la secuencia de diversos genomas de A. paragallinarum y así poder identificar factores virulencia importantes en su patogenicidad que permitiesen entender de una mejor manera el proceso patológico de esta enfermedad y que pudieran permitir un mejor control de la misma".